بعد التثبيت، يضيف Kaspersky Endpoint Security شهادة Kaspersky إلى محزن النظام للحصول على شهادات موثوقة (مخزن شهادات Windows). يستخدم Kaspersky Endpoint Security هذه الشهادة لفحص الاتصالات المشفرة. Kaspersky Endpoint Security يشمل كذلك استخدام تخزين النظام للشهادات الموثوقة في Firefox وThunderbird لفحص المرور على هذه التطبيقات.
يمكن لمكونات Web Control، والحماية من تهديدات البريد، والحماية من تهديدات الويب فك تشفير وفحص حركة الشبكة المرسلة عبر الاتصالات المشفرة باستخدام البروتوكولات التالية: